Bộ phim mở ra với một thế giới huyền huyễn, nơi mà thứ sức mạnh Thần Lực được đặt lên trên tất cả, mà để có được nó thì tất cả mọi người đều phải trải qua tu luyện. Nguyên Tôn cũng xoay quanh nhân vật chính là Chu Nguyên, bản thân là thái tử của Đại Chu vương triều và có trong mình vận khí Thánh Long, chẳng may Chu Nguyên lại bị Đại Vũ quốc lập mưu cướp đoạt ngay từ khi chào đời. Đó cũng là nguy cơ khiên Đại Chu vương triều đứng bên bờ diệt vong. Và cũng từ đó mà câu chuyện bắt đầu mở ra, Chu Nguyên bằng tất cả nỗ lực và sự giúp đỡ từ sư phụ, những người bạn, bắt đầu bước vào con đường tu luyện để giành lại những gì vốn thuộc về mình.
Hệ thống tu luyện
Tu luyện giả phun ra nuốt vào thiên địa bản nguyên lực, bản thân thuế biến, cho nên gọi Nguyên Sư.
— Khai mạch: Gồm 8 mạch. Đả thông kinh mạch, nâng cao tố chất thân thể.
— Dưỡng khí: Phân Sơ -Trung – Hậu.
— Thiên quan: Phân Sơ -Trung – Hậu.
— Thái sơ: Gồm 9 tầng.
— Thần phủ: Phân Sơ -Trung – Hậu.
— Thiên dương: Phân Sơ -Trung – Hậu.
— Nguyên anh: Phân ra tiểu nguyên anh, đại nguyên anh, nguyên anh viên mãn
— Ngụy pháp vực: Không rõ phân chia.
— Pháp vực: Phân ra phổ thông pháp vực, linh pháp vực, bảo pháp vực.
— Ngụy thánh: Gồm thánh giả chi hỏa và thánh giả chi bảo.
— Thánh giả: Phân thành Nhất Liên – Nhị Liên – Tam Liên.
— Thần giả: Phân thành Đệ Nhất Tự Liệt – Đệ Nhị Tự Liệt – Đệ Tam Tự Liệt.
Chỉ có cường đại thần hồn, mới có thể khắc hoạ ra nguyên văn đẳng cấp cao. Thần hồn thành thánh, mới có thể tiến nhập thánh cảnh.
— Hư cảnh: Phân sơ – trung – hậu – đại viên mãn. Cảnh giới thứ 1, Hư cảnh tương đương Khai Mạch, hậu kỳ tương đương Thiên Quan cảnh.
— Thực cảnh: Phân sơ – trung – hậu – đại viên mãn. Cảnh giới thứ 2, Thực cảnh tương đương Thánh Sơ cảnh.
— Hóa cảnh: Phân sơ – trung – hậu – đại viên mãn. Cảnh giới thứ 3, Hóa cảnh sơ kỳ có thể sánh ngang Thần Phủ cảnh, hậu kỳ thì tương đương Nguyên Anh cảnh.
— Du Thần cảnh: Phân sơ – trung – hậu – đại viên mãn. Cảnh giới thứ 4, Du Thần cảnh sơ kỳ có thể sánh ngang Pháp Vực cảnh.